Nastanek bolezni je posledica porušenega ravnotežja med človekovimi zaščitnimi mehanizmi in lastnostmi, ki jih imajo nekateri mikroorganizmi. Te lastnosti so povezane predvsem z razširjanjem med različnimi vrstami gostitelja (ljudje in živali), preživetjem v gostitelju in s povzročanjem škode, kar nazadnje prepoznamo kot bolezenske znake (npr. vročina, bruhanje…).
Govorili bomo o nekaterih trenutno bolj 'modernih' povzročiteljih bolezni, kot je virus gripe, pa tudi o tem kako mikrobiologi proučujejo mikroorganizme, ki povzročajo bolezni, ter kako in zakaj določamo mikrobne prstne odtise.