No has comentado algo que a mi me parece básico en las panorámicas y es el tema del horizonte, si te fijas el PTGui es el único que lo ha enderezado correctamente. No sé si el autopano tiene alguna herramienta que te lo permita corregir, pero el PS CS3 no.
Soy usuario del PTGui, creo que es el mejor programa de panorámicas actualmente en el mercado.
Un saludo!

gracias por el apunte Pau, tienes raón